Hansen là người gốc Đan Mạch, ông kết hôn với Grace Tsiang là con gái của nhà kinh tế nổi tiếng Sho-Chieh Tsiang, người Mỹ gốc Trung Quốc[3]. Hansen và Tsiang có một con trai là Peter. Ông có hai anh em, Ted Howard Hansen, một nhà miễn dịch tại Đại học Washington ở St Louis và Roger Hansen, một kỹ sư thuộc lĩnh vực quản lý tài nguyên nước. Cha của Hansen, Roger Gaurth Hansen, là một giáo sư hóa sinh và hiệu trưởng của trường Đại học bang Utah.